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目的
根据粉末或单晶衍射数据进行晶体结构求解,采用计算衍射图样与测量衍射图样之差和系统势能(“帕累托优化”)相结合的全局优化方法。
功能
结构求解:
  • 利用传统 X 射线实验室衍射仪以及同步辐射、中子或电子衍射数据进行结构求解
  • 所需输入
    • 单胞参数
    • 衍射数据:粉末衍射数据(布拉格角的累积强度(非峰型/步进扫描数据),从 Philips、Bruker-AXS、Stoe 导入),或单晶衍射数据(I(hkl)、|F(hkl)| 或 F2(hkl)),例如从 SHELX 文件导入的数据
    • 晶胞内容(成分或分子结构加化学式单位数)
  • “向导"使数据导入准备更易用
  • 自动调整所有结构求解计算参数
  • 根据实验峰和计算峰列表计算峰型图,而不仅仅是比较相关峰的强度。通过这种方法,R 因子计算对 2theta 误差和错误峰分配的敏感性大大降低。在早期版本的 Endeavour 中,这个问题经常会导致 R 因子值错误,并可能导致整个晶体结构无法求解。
  • 根据结果结构自动确定空间群
  • 可选择或自动检查/纠正 2theta 误差。
  • 自动检查峰值相关性(可选,默认为激活)。
  • 多种 “高级设置”,如灵活分子、跳转宽度、峰三角、模拟退火参数等——可通过结构求解向导进行设置。
  • 含有分子/刚体的晶体结构现在可以直接在 P1 以外的空间群中求解,即使其原子必须被置于特殊位置。
  • 查看结构求解过程的中间步骤:进度(完成百分比)、R 值和总成本函数、相关计算峰和观测峰列表、结构图以及用户自定义排列的并排衍射图。
  • 自动构建(Auto Build)功能可将每个中间步骤的晶体结构可视化,例如晶胞、有键或无键、有多面体或无多面体、分子等。
  • 报告视图以格式化文本形式显示帕累托优化结果,可复制到剪贴板、保存或打印。
  • 轻松编辑、计算和拟合潜在参数(简单斥力、兰纳-琼斯)。
  • 现在已实现所有元素对组合的最小原子间距(由Pearson's Crystal Data得出)(不再需要手动调整简单斥力势的参数)
  • 支持分子和原子晶体结构。分子可以固定在特定位置,也可以沿参考原子旋转。
  • 对称性查找器,可自动或交互式转换到更高的空间群。
  • 可通过能量最小化或衍射数据进行 “结构求解”。手动选择分子中的可旋转键,以便在结构求解计算过程中进行更改。
  • 从各种文件格式导入三维分子结构,包括 Diamond (*.dsf)、Cambridge CSD-FDAT (*.dat、*.fdat、*.csd)、MDL Molfile/SDFile(例如来自 ACD ChemSketch 的文件)(*.mol、*.mdl、*.sd)、Cerius2 CSSR (*.cssr、*.dat)、Sybyl MOL/MOL2 (*.mol, *.mol2) 和 CIF (*.cif) 文件。
  • 还可以使用 ACD ChemSketch Freeware 绘制分子草图并将其转换为三维图像,该软件可从 Endeavour 1.x CD-ROM 中安装。
结构可视化:
  • 结构可视化 “自动构建”功能的设置(如分子、多面体)现在可根据所研究化合物的 “化学性质”自动调整。
  • 手动输入或更改结构参数和书目数据。
  • 从晶体结构数据库(无机晶体结构数据库、剑桥结构数据库、蛋白质数据库)、Pauling File(无机材料数据库)、晶体学信息文件(CIF)、SHELX 格式以及多种分子结构格式导入结构数据。
  • 创建晶胞、超晶胞或任意晶格范围的内容。
  • 利用直方图完成对连通性的判断,可显示所选原子类型之间的距离分布,并自动计算距离范围。
  • 完成选定原子周围的配位层。
  • 生成分子或完成在晶胞边缘被剪切的分子片段(堆积图)。
  • 球棍、金属丝和空间填充模型。中央或平行投影、深度提示、立体显示。
  • 照片般逼真的渲染模型,用户可自定义光源和材料属性(OpenGL)。
  • 旋转、移动和缩放:鼠标控制、键盘逐步控制或数字控制。沿指定轴或朝向 hkl 平面的视图。
  • 在选定原子周围的配位多面体,或可手动构建带有阴影、不透明或透明的面。
  • 显示热椭球体,使各向异性位移参数可视化。
  • 标记原子和化学键。可按类型或单独指定原子和化学键的颜色、样式和半径。
一般功能:
  • 32 位 MS Windows 应用程序,具有标签式多文档界面 (MDI)、上下文关联菜单和工具栏。允许 “同时”处理多个结构。
  • 用户可自定义并排排列结构图和衍射图以及若干文本数据。
  • 多步骤撤消和重做功能。
  • 计算或交互式测量距离、角度和扭转角,包括标准不确定度。
  • 可导出为晶体和分子结构格式、峰值和|F(hkl)|格式、Windows 元文件、多种位图格式以及虚拟现实建模语言(VRML)。
  • 在线更新(自动或手动)。
系统要求
  • 装有 MS Windows® XP、Vista、Windows 7、Windows 8/8.1 或 Windows 10 操作系统的个人电脑(不能在 Windows RT 或 Windows 10 S 或 Windows 10 “S 模式”下运行)
  • Microsoft Internet Explorer 5.01 或更高版本
  • 64 MB 内存
  • 100 MB 可用磁盘空间
  • 图形分辨率为 1024 x 768 像素,32,768 色(“高彩”)。
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